De counselor is op het Mendelcollege een speciaal opgeleide docent die in samenwerking met de schoolleiding, afdelingsleiders, mentoren, ouders en leerlingen zorgt voor een goed leef- en werkklimaat voor de leerlingen binnen de school. De counselor voert begeleidingsgesprekken, ondersteunt mentoren en onderhoudt externe contacten met hulpverlenende instanties in de regio. Hij biedt psychosociale begeleiding rond het onderwijsleerproces (bijvoorbeeld: pesten/gepest worden, eenzaam voelen in de klas, motivatieproblemen), en begeleiding bij problemen in de persoonlijke sfeer (bijvoorbeeld: problemen thuis, verwerking van scheiding van ouders, misbruik, mishandeling, rouwverwerking, stress).